Oups, le SARS-CoV en 2015...

«  Un foyer de coranavirus de chauves-souris ressemblant au SARS pourrait contaminer les êtres humains »
Vineet D Menachery1, Boyd L Yount Jr1, Kari Debbink1,2, Sudhakar Agnihothram3, Lisa E Gralinski1, Jessica A Plante1, Rachel L Graham1, Trevor Scobey1, Xing-Yi Ge4, Eric F Donaldson1, Scott H Randell5,6, Antonio Lanzavecchia7, Wayne A Marasco8,9, Zhengli-Li Shi4 & Ralph S Baric1,2

Citation :

Avertissement : le texte ci-dessous est la traduction en français d'un article publié en 2015 en langue anglaise
(https://www.nature.com/articles/nm.3985?fbcldi=lwAROiTTfDIT-uxNFPtvQHxFrF6QaF1hKE1Ey2TPrEi17XfFUIbpUIAosDc)
dans le journal Nature Medicine en libre accès sur internet. Elle a pour but de permettre une lecture affranchie de la difficulté de l'anglais technique pour les personnes ne maîtrisant ni l'anglais ni le vocabulaire de la recherche en virologie et la microbiologie. Bien que rigoureuse cette traduction ne saurait d'aucune façon être cité comme les dires des auteurs du texte original. Les phrases essentielles à la compréhension sont surlignées en jaune.

http://www.francesoir.fr/sites/francesoir/files/media-icons/Shi-Zhenf-Li-et-R.S-Baric-2015_ok.pdf

Extraits :

Citation :

L’émergence du syndrome respiratoire aiguë causé par le coronavirus SARS-CoV ainsi que du syndrome respiratoire du Moyen-Orient causé par le coronavirus MERS-CoV illustre la menace de transmission virale inter-espèces conduisant à des épidémies chez l'être humain. Ici, nous examinons le potentiel pathogénique d'un virus de type SARS, SHC014-CoV, qui circule dans les populations de chauves-souris fer à cheval chinoises [1].

Citation :

L'évaluation des thérapies immunes contre le SARS et des modalités prophylactiques montre peu d'efficacité; que ce soit par l'intermédiaire d'anticorps monoclonaux ou de vaccins...

Citation :

Le virus hybride ainsi construit nous a permis d'évaluer la capacité de cette nouvelle protéine S de causer une maladie indépendamment des autres mutations d'adaptation nécessaires dans sa structure naturelle. Avec cette approche nous avons caractérisé in vivo dans les cellules respiratoires supérieures humaines une infection CoV dont la médiation est assurée par la protéine SHC014 et testé l'efficacité des thérapies immunes à disposition contre le virus hybride SHC014-CoV. Prise dans son ensemble, cette stratégie a permis à partir de données méta-génomiques d'aider à prédire et se préparer pour de futur virus émergent

Citation :

Pour évaluer l'efficacité des vaccins existants contre l'infection par le SHC014-MA15, nous avons vacciné les souris âgées avec le virus complet du SARS-CoV doublement inactivé (DIV). Des travaux précédents ont montré qu'un DIV pouvait protéger les jeunes souris d'un challenge avec un virus homologue [14];
. Ici nous avons trouvé que le DIV n'a pas conféré de protection vis-à-vis d'un challenge avec le SHC014-MA15 en terme de perte de poids et de concentration virale (Supplément Fig. 5a,b). Cela est cohérent avec des études précédentes qui ont montré qu'avec d'autres CoVs hétérologues du groupe 2b [15], des sérums de souris âgées vaccinées par DIV ont échoué à neutraliser le SHC014-MA15 (Supplément Fig. 5c). Notamment, la vaccination par DIV a produit des pathologies immunes marquées Supplément Table 4) et de l'eosinophilie
(Supplément Fig. 5d–f).
L'ensemble de ces observations confirme que le vaccin par virus atténué ne protégerait pas contre une infection par SHC014 et pourrait probablement augmenter la maladie dans un groupe vacciné plus âgé (note du traducteur - ici les auteurs implicitement parlent des êtres humains

Citation :

Ayant établi que la protéine SHC014 permet l'infection de cellules
humaine et permet de causer une maladie respiratoire chez les souris,
nous avons synthétisé le clone viral infectieux complet du SHC014-
CoV de la même façon que pour le SARS-CoV (Fig. 3a)

Citation :

. Ensemble ces résultats établissent la viabilité du SHC014-CoV chez d'autres mammifères mais suggère que plus d'adaptation est nécessaire pour que sa réplication soit au même niveau que celle de l'épidémie de SARS-CoV dans les cellules respiratoires humaines et chez les souris (note du traducteur, ici les auteurs expliquent implicitement que sans l'ajout de la protéine S le
SHC014-CoV de chauve souris est inopérant chez l'homme).

Citation :

Cependant, selon ces deux paradigmes l'adaptation de la protéine S dans un hôte intermédiaire est vue comme une nécessité, avec la plupart des mutations attendues dans le RBD, facilitant de ce fait le pouvoir d'infection. Les deux théories impliquent que les réservoirs de CoV de chauves-souris sont limités et que les mutations qui permettent le saut d'espèce sont rares, réduisant la possibilité d'émergence future chez les humains.

Citation :

Cette hypothèse est illustrée par la capacité du virus chimérique contenant la protéine SHC014 insérée dans le squelette du virus SARS-CoV à causer de fortes infections à la fois dans les cultures de cellules des voies respiratoires humaines et chez les souris sans qu'il y ait besoin d’adaptation.

Citation :

Notamment, bien que le virus SHC014-CoV requiert probablement des adaptions au niveau de son squelette (structure de base) pour pouvoir se transmettre à l'homme, la haute fréquence des recombinaisons observées dans la famille de virus CoV souligne la possibilité d'émergence future chez l'homme et le besoin de s'y préparer.

Citation :

A ce jour, le screening génomique des populations animales a été utilisé principalement pour identifier des nouveaux virus dans le cadre de percées épidémiques [21]. L'approche entreprise ici étend ces données pour examiner la question de l'émergence virale et de l'efficacité thérapeutique.
De plus, la pathogénie observée chez les souris indique une capacité pour les virus contenant la protéine SHC014 de causer une maladie dans les modèles mammifères sans adaptation du RBD.

Citation :

Ainsi, relativement à la protéine S- MA15 du virus CoV Urbani, le SHC014-MA15 présente un gain de pathogénie (Fig. 1). Sur cette base, les panels d'experts scientifiques peuvent juger que des études similaires de construction de virus chimériques à partir de souches circulantes seraient trop risquées pour être poursuivies étant donnée qu'une augmentation de phatogénie dans les modèles mammifères ne peut être exclue. Couplé avec les restrictions sur les souches virales adaptées aux souris et sur le développement d'anticorps monoclonaux utilisant le principe des 'escape' mutants, le progrès des recherches sur l'émergence des CoVs et des thérapies efficaces pourrait être sévèrement limité.

Citation :

En résumé, notre approche a utilisé des données méta-génomiques pour identifier la menace potentielle que pose la circulation de virus de chauves-souris semblables au SARS-CoV. En raison de la capacité des virus chimériques portant la protéine spicule SHC014 de se répliquer dans les cultures de cellules de voies respiratoires humaines, causant de la pathogénie in vivo et échappant aux thérapies existantes, il y a un besoin à la fois pour la surveillance et des moyens thérapeutiques améliorés contre les virus SARS circulants. Notre approche ouvre également la possibilité d'utiliser des données méta-génomiques pour prédire les émergences virales infectieuses et appliquer cette connaissance à la préparation de traitements des futures épidémie.